آلوده شدن آب های زیر زمینی به نیترات و مواد رادیواکتیو و مواد صنعتی را می‌توان از جمله مهمترین روش‌های تروریستی دانست که در آن تلاش می‌شود که با انهدام منابع آبی، سلامت جسمی مردم مورد تهدید و صدمه قرار گیرد. در این مطالعه از مدل سازی ریاضی، به عنوان یکی از روشهای پرکاربرد در علوم بیولوژیکی، به منظور شبیه سازی جنگ های بیولوژیکی استفاده شده است. در این روش یک مدل ریاضی با تخمین پارامترهای هیدرولیکی و هیدرولوژیکی برای جریان آبهای زیرزمینی بدست می‌آید که از آن می‌توان برای مدیریت منابع آب های زیرزمینی بهره گرفت. شبیه سازی ریاضی ارائه شده در این مقاله به عنوان یک الگوریتم عددی، با فراهم کردن امکان شناسایی مبدا تولید آلودگی آب‌های زیرزمینی و بازسازی زمان و مکان انتشار آن، نرم افزاری امنیتی-راهبردی را در مطالعات پدافند غیر عامل به منظور حفظ و ارتقاء سلامت و امنیت منابع آبی در اختیار قرار می‌دهد.